Para codificar las columnas de un dataframe vamos a recorrerlas comprobando su tipo. En el caso de ser "object" la mostramos en pantalla y la codificamos con LabelEncoder (hay otras formas de ejecutar esta codificación). En el siguiente código se entrena ("fit") el codificador "LabelEncoder" y se aplica ("transform") a la columna en dos pasos, aunque podría hacerse con un solo paso, hacienod uso del método "fit_transform":
for c in df.columns:
if df[c].dtype == 'object':
print(c)
lbl = LabelEncoder()
lbl.fit(list(df[c].values))
df[c] = lbl.transform(list(df[c].values))
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